Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Limd1Q9QXD8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Limd1Q9QXD8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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Limd1Q9QXD8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Limd1Q9QXD8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Limd1Q9QXD8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms