Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cabp1Q9JLK7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cabp1Q9JLK7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms