Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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FancaQ9JL70 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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FancaQ9JL70 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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FancaQ9JL70 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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FancaQ9JL70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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FancaQ9JL70 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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FancaQ9JL70 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancaQ9JL70 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FancaQ9JL70 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FancaQ9JL70 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FancaQ9JL70 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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FancaQ9JL70 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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FancaQ9JL70 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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FancaQ9JL70 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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