Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgn5Q9JL35 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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