Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms