Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx3Q9JKB3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms