Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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