Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra4Q9JJT2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms