Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms