Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpf2Q9JJ80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpf2Q9JJ80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms