Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tm9sf3Q9ET30 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tm9sf3Q9ET30 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tm9sf3Q9ET30 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tm9sf3Q9ET30 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tm9sf3Q9ET30 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tm9sf3Q9ET30 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms