Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms