Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms