Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms