Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc46a3Q9DC26 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms