Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms