Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms