Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift43Q9DA69 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms