Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smco2Q9DA21 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms