Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl17Q9D8P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl17Q9D8P4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms