Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
U2af1Q9D883 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms