Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clic3Q9D7P7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms