Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms