Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc81Q9D5W4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms