Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931423N10RikQ9D4J9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms