Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clvs1Q9D4C9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms