Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syce1Q9D495 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms