Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc71Q9D3W5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc71Q9D3W5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms