Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms