Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D930007J09RikQ9D2K6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms