Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms