Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exosc7Q9D0M0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms