Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms