Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms