Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mis12Q9CY25 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms