Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs4Q9CXZ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms