Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl11Q9CXW4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms