Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Sgo1Q9CXH7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Sgo1Q9CXH7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Sgo1Q9CXH7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Sgo1Q9CXH7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Sgo1Q9CXH7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sgo1Q9CXH7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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