Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd4Q9CWX4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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