Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms