Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms