Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms