Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms