Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc43Q9CR29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms