Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PclafQ9CQX4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms