Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms