Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms