Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atp6v0e1Q9CQD8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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