Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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