Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc1Q9CPZ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms